U Laboratoriji za bentos i zaštitu mora se obavljaju osnovna, primijenjena i razvojna istraživanja iz oblasti istraživanja, analize i monitoringa morskih organizama bentosa (dna) i zaštita mora, a posebno: izučavanje fitobentosa, tj. makroalgi i morskih cvjetnica (biodiverzitet, biomasa,  pokrovnost, zajednice, uticaj zagađenja i drugo); izučavanje zoobentosa u svim segmentima, tako da se ovaj dio aktivnosti odnosi na veoma evolutivno i taksonomski raznovrsne grupe organizama, počev od sunđera i korala, preko crva, mekušaca, bodljokožaca, zglavkara, glavonožaca do hordata (biodiverzitet, biomasa, zajednice, uticaj zagađenja i drugo); izučavanje...